اعضای شوراها از 30 منطقه و حوزه انتخابیه برادران و خواهران با رأی مستقیم طلاب انتخاب شده و در قالب 4 کمیسیون تخصصی برادران و 2 کمیسیون تخصصی خواهران فعالیت می نمایند.

الف )کمیسیون های تخصصی (برادران )

کمیسیون تخصصی آموزش و پژوهش

کمیسیون تخصصی پذیرش ،دانش آموختگان ، اعزام و تبلیغ

کمیسیون تخصصی امور رفاهی ، خانواده و فرزندان

کمیسیون تخصصی فرهنگی و تربیتی

ب) کمیسیون تخصصی (خواهران )

کمیسیون تخصصی آموزش، پژوهش ، پذیرش، دانش آموختگان، اعزام و تبلیغ

کمیسیون تخصصی فرهنگی و تربیتی ، امور رفاهی ، خانواده و فرزندان

تبصره : دبیرخانه  مشاوران منطقه ای می تواند جلسه مشترک با چند کمیسیون ( برادر و خواهر ) برگزار نماید.

این کمیسیون ها تا کنون بیش از 100 جلسه در موضوعات مختلف و نیز 250 جلسه با طلاب مناطق مختلف و 50 جلسه با مدیران بخش های مختلف المصطفی  جهت ارائه نقطه نظرات خود برگزار نموده اند.